医用纯水机的系统是由预处理系统、反渗透纯水系统、EDI深度除盐系统、后处理系统、循环供水系统组成的，使用安全、方便，运行费用低廉，产水水质稳定。
医用纯水机主要用于血透室、生化室、口腔科、供应室中心实验室、制剂室、手术室等集中供水。医药行业用纯水一直以来都是高标准，严规定的，医用纯水关系到百姓的身体健康，所以医用纯水必须经过严格的工艺处理。
医用纯水机采用全自动控制（同时亦可采用手动控制），系统运行时可设定自动反洗、再生程序；一级反渗透和二级反渗透设有回流管道，反渗透设备设有化学清洗装置和消毒装置。